UPT Instalasi Farmasi merupakan unit pelaksana teknis pada Dinas Kesehatan yang mengelola obat, vaksin dan Bahan Medis Habis Pakai (BMHP) di Kabupaten Magelang. 

Tugas dan Fungsi UPT Instalasi Farmasi Kabupaten Magelang :

1. Perumusan kebijakan teknis pengelolaan obat, vaksin dan Bahan Medis Habis Pakai (BMHP)

2. Penyelenggaraan perencanaan analisis kebutuhan obat, vaksin, dan Bahan Medis Habis Pakai (BMHP)

3. Penyelenggaraan penerimaan, penyimpanan, penyediaan, dan pendistribusian obat, vaksin, dan Bahan Medis Habis Pakai (BMHP)

4. Penyelenggaraan pengadaan obat dan Bahan Medis Habis Pakai (BMHP)

5. Pengawasan dan pengendalian pemanfaatan obat, vaksin dan Bahan Medis Habis Pakai (BMHP)

6. Penyelenggaraan Pencatatan Pelaporan obat, vaksin dan Bahan Medis Habis Pakai (BMHP)

7. Monitoring dan Evaluasi obat, vaksin dan Bahan Medis Habis Pakai (BMHP)

8. Penyelenggaraan ketatausahaan, dan

9. Pelaksanaan tugas  lain yang diberikan oleh Kepala Dinas sesuai dengan tugas dan fungsinya.